Perseus è protetto contro le copie illegali con un sistema di codici di attivazione, e richiede che ogni installazione venga attivata da questo sito, anche senza inserire dati personali. È possibile disporre contemporaneamente di tre installazioni; una copia installata ma non attivata può girare fino a un massimo di venti volte su quel PC. È possibile spostare Perseus da un PC all'altro, disinstallandolo dal primo e installandolo sul secondo, quante volte si desidera. Si veda il manuale per maggiori dettagli.
